為改善農民賴以生活之農業環境及兼顧農村生態保育，促進農業資源永續利用，本處自民國77年起即協助各直轄市、縣(市)政府辦理早期農地重劃區農水路更新改善先期規劃、工程設計及施工監造等工作，早期農地重劃區係指民國60年以前完成農地重劃之地區，將寬度原僅為2.5至3公尺之狹窄農路及年久失修水路渠道，一併更新改善，建設完善農水路系統，同時考量減少工程施設對農地環境的衝擊，加入各項生態工程設計，營造滿足農村地區生物生存基本需求的友善生態環境，以兼顧維護農村自然生態及景觀風貌。
本處110年辦理早期農地重劃區施工監造計16區，面積共1,019公頃，預計於111年陸續完工，詳早期農地重劃區農水路更新改善工程施工監造區一覽表。
工程地點：雲林縣大埤鄉。 工程範圍：東至：西部幹線鐵路，西至：田寮大排，南至：南北9路，北至：東西1路。 面積：約89公頃。 工程主辦機關：雲林縣政府。 規劃設計及監造機關：內政部土地重劃工程處。
工程地點：臺南市鹽水區。 工程範圍：東至：西部幹線鐵路，西至：田寮大排，南至：南北9路，北至：東西1路。 面積：約98公頃。 工程主辦機關：臺南市政府。 規劃設計及監造機關：內政部土地重劃工程處。
工程地點：臺南市六甲區。 工程範圍：東至：台1線，西至：南北1路，南至：南北4路，北至：南北5路。 面積：約17公頃。 工程主辦機關：臺南市政府。 規劃設計及監造機關：內政部土地重劃工程處。
工程地點：臺南市下營區。 工程範圍：東至:東西12路，西至:東西1路，南至:麻豆大排水溝，北至:朝興南路。 面積：約145公頃。 工程主辦機關：臺南市政府。 規劃設計及監造機關：內政部土地重劃工程處。
工程地點：雲林縣斗六市。 工程範圍：東至雲157、159線，西至尖山大排，南至水井分線，北至東西農路。 面積：約56公頃。 工程主辦機關：雲林縣政府。 規劃設計及監造機關：內政部土地重劃工程處。
工程地點：宜蘭縣壯圍鄉。 工程範圍：東起新南路，西至東津一路，南至宜18線，北至中興七路。 面積：47公頃。 工程主辦機關：宜蘭縣政府。 規劃設計及監造機關：內政部土地重劃工程處。
工程地點：花蓮縣玉里鎮。 工程範圍：位於花蓮縣玉里鎮長良里永安段，距離玉里鎮公所約6公里。 面積：約27公頃。 工程主辦機關：花蓮縣政府。 規劃設計及監造機關：內政部土地重劃工程處。
工程地點：彰化縣秀水鄉。 工程範圍：東至竹塘鄉田頭村鄉界，西至彰177光明路廣福巷，南迄田頭堤防，北達竹林路一段大新巷。 面積：約31公頃。 工程主辦機關：彰化縣政府。 規劃設計及監造機關：內政部土地重劃工程處。
工程地點：雲林縣元長鄉。 工程範圍：東鄰雲169鄉道，西至西瓦磘中排，南迄元長大排，北達160縣道。 面積：約27公頃。 工程主辦機關：雲林縣政府。 規劃設計及監造機關：內政部土地重劃工程處。